Proses terbentuknya Desa Watumbelar seiring dengan  perubahan sistem  dan tata Pemerintahan  Republik Indonesia,dimana dimulai dari kerajaan,swapraja dan kepala kampung pada tahun 1942 – 1958 Desa Watumbelar hanya berstatus sebagai kampung dibawah kekuasaan swapraja kecil Lewa Paku.

Berdasarkan surat keputusan Gubernur Kepala Daerah  Tingakat I NTT Nomor :

Pem/1/35,Tanggal 5 Juni 1962 di bentuk 64 kecamatan di provinsi NTT termasuk 6(enam)kecamatan di kabupaten disumba Timur,ini merupakan suatu indikasi kearah penghapusan Swapraja secara bertahap. Dengan demikian  secara De Yure,45 Swapraja yang ada di Provinsi NTT saat itu sudah dihapus,namun secara De Facto baru pada saat diundangkannya undang-undang Nomor 8 Tahun 1965,dimana 7(tujuh) diantaranya ada dikabupaten Sumba Timur yakni Swapraja Kanatang-kapunduk,Lewa kambera,  ,Tabundung,Rindi Umalulu,Mangili,WulaWaijelu,dan Swapraja Masu-Karera.

Dengan berubahnya masa swapraja menjadi kecamatan maka kepemimpinan wilayah yang pada saat itu dikenal sebutan Kepala Swapraja berubah menjadi camat.demikian halnya dengan istilah  Kepala  Letu berubah menjadi Kepala  Desa.

Sebelum terbentuknya Desa Watumbelar sebagai wilayah pemerintahan Swapraja kecil Lewa Tidahu yang dipimpin oleh Bapak Raja Umbu Nai Ndima dan Wakil Swapraja Wialayah selatan Lewa Tidahu dipimpin oleh Bapak Letu Hapu landu kara dari Tahun 1942 sampai dengan Tahun 1961  kekuasaan terdiri dari    :

1. Kampung Lewa paku dipimpin oleh Bapak Letu Hapu Landu Kara.
2. Kampung Kangeli dipimpin oleh Bpk Letu Mberu Lata
3. Kampung Konda mara dipimpin olehBpk Letu Meta Yiwa
4. Kampung paulangga dipimpin oleh Bapak Letu Bakandamanyola
5. Kampung praibakul dipimpin oleh Letu Katu waluwanja
6. Kampung Watumbelar dipimpin oleh Bapak Letu Umbu Ndena Mbani

Pada Tahun 2007 terjadi pemekaran wilayah kecamatan yakni kecamatan Lewa dengan kecamatan Lewa Tidahu,mulai Tahun2007 Desa Watumbelar bergabung dengan kecamatan Lewa Tidahu  sampai dengan saat ini 

Adapun pemimpin yang pernah menjabat sebagai kepala Desa Watumbelar sejak Tahun 1962

1. Bapak Nuku Hamba Ora Tahun (1962 s/d 1970 )dengan juru tulis Bapak Thomas babu maramba njara
2. Bapak Umbu Ndena Mbani Tahun (1970 s/d 1972)dengan juru tulis Bapak Thomas babu maramba njara
3. BapakNuku Hamba Ora Tahun (1972 s/d 1980)dengan juru tulis Bapak Thomas babu maramba njara
4. Bapak Muka NdjaraTahun (1980 s/d 1988)dengan juru tulis Bapak Kapongu ndahanggongu
5. Bapak Agustinus Hamba Banju Tahun (1988 s/d 1996) dengan juru tulis Bapak Hendrik Hapu Larung
6. Bapak Wunu Ndaku larak Tahun (1996 s/d 2002)dengan juru tulis Bapak Hendrik Hapu Larung
7. Bapak Hendrik Hapu Larung Tahun (2004/2008)dengan juru tulis Bapak Alex katuhanggar
8. Bapak Amos Keba KahudangTahun (2008 s/d 2014.) dengan juru tulis Bapak Alex katuhanggar
9. Bapak Yunus keba Lumbu Lamba Tahun (2015 s/d 2020) dengan juru tulis Bapak Alex Katuhanggar
10. Bapak Plt. Fritz Landukara, S.Sos Tahun(2021 s/d 2021 dengan juru Tulis Bapak Amos Peli Manuhuluk
11. Bapak Umbu Nuku Hamba Ora Tahun ( 2022 s/d 2028 dengan juru Tulis Bapak Amos Peli Manuhuluk